Делать разрывы (в днях) при проведении проверки не положено...
Утвержден
Приказом
Генерального прокурора
Российской Федерации
от 11.08.2010 N 313
ПОРЯДОК
ФОРМИРОВАНИЯ ОРГАНАМИ ПРОКУРАТУРЫ ЕЖЕГОДНОГО СВОДНОГО
ПЛАНА ПРОВЕДЕНИЯ ПЛАНОВЫХ ПРОВЕРОК ЮРИДИЧЕСКИХ ЛИЦ
И ИНДИВИДУАЛЬНЫХ ПРЕДПРИНИМАТЕЛЕЙ
...
8.
...
Законом не предусматривается приостановление либо прерывание плановой проверки.Конечно, это цитата из приказа генеральной прокуратуры, который не является нормативным правовым актом. Но именно органы прокуратуры осуществляют контроль за остальными контрольными органами (ну и надзор за остальными надзорными органами...

)
Так что если написано в распоряжении - проверка ТРИ рабочих дня, то они должны идти подряд, а не по дню в неделю.
Другое дело, если плановый срок проверки, допустим, 20 рабочих дней. Инспектор пришел в первый день, ознакомил гену с распоряжением, что-то попроверял. Потом пришел через день, еще что-то проверил. И еще через недельку посидел пару дней над документами или погулял по ОПО. А на двадцатый день вручил предписание, акт, да еще и составил протокол... Вот в этом случае ничего не нарушено - проверка шла двадцать дней подряд.