Помогите пожалуйста! Заказчик навязывает строительной фирме, для прохождения на его территорию, прохождение переодического медицинского осмотра в определенном лечебном учереждении (когда работники строительной фирмы уже прошли переодический осмотр в лицензированном учереждении, с которым у нее заключен договор). Подскажите, пожалуйста, законно ли это и на какими пунктами нормативной документации оперировать.

Какими пунктами нормативной документации Вы хотите оперировать к Заказчику?
Если этих требований нет в Вашем Договоре, то можно на это ссылаться.
А так, не хотите выполнять требования Заказчика, значит и работать на его объекте не будете.

Я все понимаю, что на территории Заказчика, законом является сам Заказчик. Но у нас подрядные организации приезжают со всей России и из-за границы и не целесообразно проводить мед.комиссию в одной организации, когда вводный инструктаж проходят ежедневно работников порядком 100-150 человек. Тем более что бы пройти нарколога в данной организации требуется военный билет и мед.справка из своей организации.
Заказчик ссылается, что по мед.комиссии нужно проходить дополнительные факторы, которые не учитываются подрядными организациями в их направлениях. Хотя было написано самим заказчиком письмо, что не каких вредных веществ на отведенной территории нет.

Мягко официально запросите докУмент с штепселем от Заказчика с обоснованием этого требования или дополнительного соглашение к договору.
Обоснуйте, что Вам нужна официальная мотивация для дополнительных телодвижений

ТК РФ (ст. 212): "Обязанности по обеспечению безопасных условий и охраны труда возлагаются на работодателя".
Работодателем для работника является Подрядчик, а не Заказчик. Иногда люди, подбирающие фирму для медосмотра, имеют материальный интерес - их стимулируют для выбора "нужной" конторы. Так что, возможно, дело тут не в нормативных документах.

Оперировать нужно договором подряда и стандартами заказчика, под которыми подписался, подписав договор.
Там могут быть прописаны и такие условия прохождения медосмотра и ещё много разного, под чем подрядчик подписывается.

Типа:
1.2. На каждого сотрудника Подрядчика должен быть составлен отчет о прохождении
медосмотра, который должен быть подписан сертифицированным в РФ практикующим
врачом или учреждением здравоохранения (УЗ), одобренным начальником отдела охраны
здоровьяи гигиены труда компании. Данные осмотра (свидетельства годности к работе)
хранятся в учреждении здравоохранения, при этом копии должны быть доступны в
Компании или в поликлинике на объекте подрядчика. Компания осуществляет регулярную
проверку этих данных с целью подтверждения соответствия работников подрядчика
требованиям документа «Медицинские требования к профессиональной пригодности»
http://www.sakhalinenergy.ru/media/a2ed246a-1ef8-4c59-a516-724c803f8afb.pdf

А иногда имеют интерес в отсутствии левых заключений у подрядчиков и вероятных, прямых или косвенных, неприятностей для себя. Заказчик - барин. Не хотят, путь не вписываются в условия договора.

Ага, тем более, что