Ежеквартально необходимо платить по факту, а не по лимитам и разрешениям - это касается не только отходов, но и воздуха, и воды.
Все эти проекты практически всегда разрабатываются с запасом, на всякий случай.
По отходам: Берете акты и накладные со всех организаций-приемщиков Ваших отходов за квартал - и считаете сколько по факту вывезли - это же цифры и заносите в отчет.
По воздуху: Если есть свои стационарные газоанализаторы (спросите, а вдруг и правда есть!) на источниках выбросов, то распечатываете данные за квартал - и получаете факт выбросов от этих источников. Если газоанализаторов нет, то от котельных, например, можно посчитать количество выбросов по расходу топлива. Если у Вас плата по воздуху небольшая - лучше и не заморачиваться, расчеты - это трудоемкий процесс - работодатель может не оценить Ваших усилий и посчитать сколько з/п за потраченное на расчеты время он Вам выплатил.
По воде: Здесь вапче все элементарно. Берете лаб. анализ стоков умножаете концентрацию каждого вещества на объем сточной воды за квартал (данные со счетчиков или расчетный метод) и получаете массу ЗВ.
З.Ы.: За платежи по лимитам, а не по факту - РТН может и взгреть чуть-чуть (а при проверке и не чуть-чуть) - это грубое нарушение экологического законодательства, а вдруг у Вас там сверхлимит!
З.З.Ы.: Если хотите ваще реально сэкономить - сделайте корректировку платежей за 1 и 2 кварталы 2010, а еще лучше и за 2009 год!
Уф... Какое длиннющее сообщение получилось... Даже самой читать страшно!