п. 89 ППБ 01-03 действительно предусматривает проверку работоспособности сетей противопожарного водопровода (
не кранов и гидрантов 
) причём не реже
ДВУХ раз в год (весной и осенью).
Но там ни слова нет про специализированные организации.
Но следуя логике можно предположить, что для проверки показателя
"требуемый по нормам расход воды на нужды пожаротушения" необходимо:
1. иметь на балансе противопожарный водопровод
2. иметь обученных специалистов
3. иметь поверенное (откалиброванное) оборудование и КИП
4. иметь соответствующую лицензию (а может и не надо)
Если Ваша организация подходит под все 4 пункта, то ВСЁ можете сделать самостоятельно.
Если Ваша организация подходит только под 1 пункт, то надо нанимать специализированную организацию.
Если п. 1 не выполнен, то в ответе на предписание пишем: по п.п. такому то сообщаем, что наша организация - ОАО "Пупец" не имеет на балансе противопожарные водопроводы, гидранты и пожарные краны.