Я бы оформляла 1 план мероприятий, по установленной Порядком форме. Потом п. 44 содержит полный список документов по результатам АРМ и план в этом списке только один, а не два. По моему мнению в план нужно включить все мероприятия, только напротив мероприятий по приведению условий труд в соответствие с ГНТОТ указать устраняемые вредные и опасные производственные факторы (см. сноску 6 к п. 12), а в остальных случаях этого можно не делать.
ПО поводу компенсаций: их установление - это совсем не приведение условий труда в соответствие с ГНТОТ, т.к. согласно пост. правительства №1160 ГНТОТ могут содержаться только в правилах и инструкциях по ОТ, стандартах безопасности труда и СанПиНах и им подобных док. и вообще бы я компенсации - не считала мероприятиями по улучшению условий труда. Уж если выявилась необходимость их назначения, то, как написано в п. 12 Порядка, аттестационной комиссии нужно подготовить предложения по внесению изменений в трудовые договора. Еще с одной стороны: предположим, что компенсация - это мероприятие по улучшению условий труда (только никак не по приведению УТ в соответствие с ГНОТОТ), то по результатам этого мероприятия должны реально улучшится условия труда и согласно п. 48 Порядка после этого нужно обязательно провести внеплановую аттестации - какой в ней будет смысл - я лично не вижу.

Кто бы сомневался в таком ответе. Вот только осталось разобраться о чем думали авторы Порядка, когда писали про первый план

Совершенно верно. Там в МЗСР заняты совсем другими вопросами. Как бы усидеть в своем кресле . Вот и изображают бурную деятельность с плачевными последствиями

Только от их деятельности нам все веселее и веселее...