Как этого типа оформить на кран. Никакими приказами и инструктажами нельзя иначе возникнет подозрение на трудовые отношения. Тогда как? Может у кого есть опыт?

Тут почешешь. По ГПД принимают для выполнения, какого то ограниченного во времени и объеме вида работ.
Укажете сколько подъемов опусканий должен произвести? Приказ о допуске персонала оформляется на работника, ГПД работником не является, подстава натуральная, если что, то будут трудовые отношения.

Вот именно. Приняли на погрузку металлоконструкций одного назначения и уложенных вокруг крана. Тут еще и стропальщики задействованы и карта складирования. За один день он явно их не перегрузит. Там не одна сотня тонн. Вводный еще можно провести в отдельном регистраторе, но самое главное, как допуск к крану оформить...

договор ГПХ уже подписан?

Да. Факт подписания договора означает факт "принятия" его. Но, пока, к крану не допущен.

выкладывайте договор...напишем нарушения...